Desde que asumió la presidencia en 2024, Daniel Noboa ha emprendido una serie de cambios significativos en la relación entre el Ejecutivo y las Fuerzas Armadas ecuatorianas. Su enfoque se ha centrado en reformar la estructura militar y fortalecer la cooperación para abordar la creciente inseguridad nacional.

Uno de los principales movimientos de Noboa fue el cambio completo del Alto Mando Militar al inicio de su mandato, forzando un remezón en la estructura militar y saltándose el orden de sucesión en las Fuerzas Armadas al cesar a nueve oficiales de sus cargos. Estos cambios fueron realizados en coordinación con su ministro de Defensa, Gian Carlo Loffredo, quien ha mantenido un perfil bajo en la gestión pública de la seguridad nacional.

La actual crisis de inseguridad en el país ha llevado al Gobierno a centrar su discurso en torno a la seguridad y el terrorismo, lo que ha fortalecido la relación con las Fuerzas Armadas. El estado de excepción y la declaratoria de conflicto armado interno han otorgado un respaldo político y legal a las fuerzas del orden, aumentando su popularidad y confianza tanto en el Presidente como en las instituciones militares.

Además, se ha especulado que el Gobierno podría prolongar indefinidamente el estado de excepción, permitiendo así que los militares continúen desempeñando un papel activo en la seguridad ciudadana. Sin embargo, las autoridades no han proporcionado detalles sobre las directrices específicas de trabajo de las Fuerzas Armadas en esta "guerra contra el crimen", argumentando razones de reserva.

La gestión de Noboa marca un quiebre significativo con la política anterior, especialmente durante la década correísta, donde la relación entre el Ejecutivo y las Fuerzas Armadas estuvo marcada por la tensión y las reformas impulsadas por el gobierno de Rafael Correa para subordinar el poder militar al civil.